Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ELL3Q9HB65 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ELL3Q9HB65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ELL3Q9HB65 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms