Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRPEL1Q9HAV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRPEL1Q9HAV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRPEL1Q9HAV7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms