Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1BQ9H9Y6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms