Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S4

CAB39L, Calcium-binding protein 39-like, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39LQ9H9S4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAB39LQ9H9S4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms