Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM38AQ9H6F2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms