Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLMPQ9H6B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms