Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABDQ9H4I3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms