Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3N1

TMX1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1Q9H3N1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX1Q9H3N1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMX1Q9H3N1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX1Q9H3N1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms