Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ9H0N0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ9H0N0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms