Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD1Q9GZZ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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HOXD1Q9GZZ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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HOXD1Q9GZZ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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HOXD1Q9GZZ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD1Q9GZZ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD1Q9GZZ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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