Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LNPKQ9C0E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LNPKQ9C0E8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms