Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXP3Q9BZS1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXP3Q9BZS1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXP3Q9BZS1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms