Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL3Q9BXA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms