Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTDSS2Q9BVG9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTDSS2Q9BVG9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTDSS2Q9BVG9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms