Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM109Q9BVC6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM109Q9BVC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM109Q9BVC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms