Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms