Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR3CQ9BUI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3CQ9BUI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms