Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDFIP1Q9BT67 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms