Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HINFPQ9BQA5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HINFPQ9BQA5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINFPQ9BQA5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms