Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHDC3Q9BQ90 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHDC3Q9BQ90 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHDC3Q9BQ90 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms