Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1Q99536 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAT1Q99536 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VAT1Q99536 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms