Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNKPQ96T60 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNKPQ96T60 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms