Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC7Q96QD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEPDC7Q96QD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms