Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AGAP4Q96P64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AGAP4Q96P64 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGAP4Q96P64 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AGAP4Q96P64 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms