Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KREMEN1Q96MU8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KREMEN1Q96MU8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KREMEN1Q96MU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms