Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00479Q96M42 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00479Q96M42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms