Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTUB1Q96FW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTUB1Q96FW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms