Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGF29Q96ES7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGF29Q96ES7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGF29Q96ES7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms