Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
MALSU1Q96EH3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MALSU1Q96EH3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MALSU1Q96EH3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms