Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELP4Q96EB1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ELP4Q96EB1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELP4Q96EB1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms