Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM4SF18Q96CE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TM4SF18Q96CE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM4SF18Q96CE8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms