Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFKQ969G6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RFKQ969G6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms