Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C6Q969F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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GTF3C6Q969F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C6Q969F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF3C6Q969F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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