Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL1Q92935 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL1Q92935 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL1Q92935 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL1Q92935 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL1Q92935 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL1Q92935 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL1Q92935 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms