Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4DQ92854 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA4DQ92854 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4DQ92854 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms