Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDAQ92838 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDAQ92838 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDAQ92838 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDAQ92838 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDAQ92838 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDAQ92838 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDAQ92838 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDAQ92838 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDAQ92838 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDAQ92838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDAQ92838 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms