Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RABGGTAQ92696 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGGTAQ92696 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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