Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF3Q92576 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF3Q92576 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms