Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf54Q8WWF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf54Q8WWF1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf54Q8WWF1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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