Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSC4DQ8WTU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSC4DQ8WTU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSC4DQ8WTU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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