Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R17PQ8TDU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms