Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPT2Q8TD30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPT2Q8TD30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPT2Q8TD30 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPT2Q8TD30 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPT2Q8TD30 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPT2Q8TD30 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms