Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK9Q8TD19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEK9Q8TD19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK9Q8TD19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms