Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFWD2Q8NHY2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFWD2Q8NHY2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD2Q8NHY2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD2Q8NHY2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD2Q8NHY2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFWD2Q8NHY2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFWD2Q8NHY2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms