Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBOF1Q8ND07 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBOF1Q8ND07 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBOF1Q8ND07 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms