Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA1Q8N8W4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA1Q8N8W4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms