Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RNF148Q8N7C7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF148Q8N7C7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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