Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIML2Q8N7C3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIML2Q8N7C3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIML2Q8N7C3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIML2Q8N7C3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIML2Q8N7C3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIML2Q8N7C3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIML2Q8N7C3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms