Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1KQ8N3J5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPM1KQ8N3J5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms