Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00528Q8N1L1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00528Q8N1L1 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms